Η κλήρωση για τη φάση των ομίλων του Κυπέλλου ανέδειξε κάποια πολύ ενδιαφέροντα ζευγαρώματα. Σε ό,τι αφορά στους ομίλους, κάθε γκρουπ περιλαμβάνει δύο ομάδες της Super League και δύο της Football League με τις δύο πρώτες να περνούν στην επόμενη φάση. Οι αγώνες της πρώτης αγωνιστικής θα γίνουν από 19 μέχρι 21 Σεπτεμβρίου. Η δεύτερη αγωνιστική είναι προγραμματισμένη για 24-26 Οκτωβρίου και η τρίτη για 28-30 Νοεμβρίου.
Ο Παναιτωλικός είναι στον ίδιο όμιλο με την Ξάνθη, τον Πανσερραϊκό και τον Εργοτέλη. Αυτό σημαίνει ότι ο Παναιτωλικός θα ταξιδέψει στην Ξάνθη μεσοβδόμαδα μετά την αναμέτρησή του με τον ΠΑΟΚ στην Τούμπα και πριν το εντός έδρας παιχνίδι του με τον Παναθηναϊκό για το πρωτάθλημα.Η 2η αγωνιστική θα γίνει 24, 25, 26 Οκτωβρίου και θα υποδεχτεί τον Πανσερραϊκό ανάμεσα στις αναμετρήσεις του με Κέρκυρα (εκτός) και Απόλλωνα (εντός). Η 3η αγωνιστική θα γίνει 28, 29, 30 Νοεμβρίου και θα ταξιδέψει στο Ηράκλειο να παίξει με τον Εργοτέλη, ανάμεσα στα παιχνίδια με Λάρισα (εντός) και Λαμία (εκτός) για το πρωτάθλημα.
